Wij leveren aan een selectie van Europese landen. Ziet u bij het afrekenen geen verzendopties, dan kunnen wij helaas (nog) niet naar uw land verzenden.
Alle begrippen beschrijven analyse, reconstitutie en opslag van producten die uitsluitend bestemd zijn voor in-vitro laboratoriumonderzoek. Niet voor menselijke of veterinaire toepassing.
Kennisbank
Korte definities van 50 begrippen die op deze site terugkomen: uit de analysecertificaten, de productspecificaties, de kennisbankartikelen en de reconstitutiecalculator. Alfabetisch geordend; elk begrip heeft een eigen anker en verwijst waar relevant naar verdieping.
Acetaatzout
Tegenion dat het TFA-zout van een peptide kan vervangen. Synthetische peptiden worden na de afsplitsingsstap doorgaans als TFA-zout geleverd; voor toepassingen waarin TFA stoort wordt dat zout uitgewisseld voor acetaat of hydrochloride. Welke zoutvorm een batch heeft, staat op het certificaat van analyse.
Deeltje dat tijdens massaspectrometrie aan het peptide gebonden raakt, bijvoorbeeld een natriumion. Adducten verschuiven de gemeten massa ten opzichte van de theoretische waarde; een afwijking groter dan ongeveer 1 Da verdient navraag bij de leverancier voordat een batch in gebruik wordt genomen.
Het samenklonteren van peptidemoleculen in oplossing tot grotere complexen. Aggregatie treedt onder meer op tijdens herhaalde vries-dooicycli en verlaagt de effectieve concentratie van intact peptide, vaak zonder dat de oplossing er zichtbaar anders uitziet.
Zie ookVries-dooicyclusAliquot
Deelportie van een gereconstitueerde oplossing, afgemeten op de omvang van een enkel experiment. Door direct na reconstitutie te aliquoteren en in te vriezen hoeft geen enkele portie vaker dan een keer te ontdooien, wat de belangrijkste degradatieroute van oplossingen wegneemt.
Zie ookVries-dooicyclusReconstitutieStamoplossing
Verder lezenReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
Bouwsteen van peptiden en eiwitten. Aminozuren zijn via peptidebindingen gekoppeld tot een keten; de volgorde van die keten, de sequentie, bepaalt de identiteit en de fysisch-chemische eigenschappen van het peptide, zoals netto lading en hydrofobiciteit.
AAA, kwantitatieve aminozuuranalyse
Kwantitatieve bepaling van de aminozuursamenstelling van een peptide. Wordt gebruikt om het werkelijke peptidegehalte (net peptide content) van een batch vast te stellen, waar de theoretische berekening alleen met tegenionen rekent en restwater buiten beschouwing laat.
Zie ookNet peptide contentTegenion
Steriel water waaraan 0,9% benzylalcohol is toegevoegd om bacteriegroei te remmen. Gangbaar reconstitutiemiddel in laboratoriumcontext, omdat een aangebroken vial er langer mee bruikbaar blijft dan met onbehandeld steriel water. Welk oplosmiddel per verbinding wordt geadviseerd, staat in de oplosbaarheidstabel.
Zie ookReconstitutieOplosbaarheid
Verder lezenOplosbaarheidstabel per verbindingReconstitutiecalculator
Chemical Abstracts Service
Uniek registratienummer van de Chemical Abstracts Service dat een chemische verbinding eenduidig identificeert, onafhankelijk van merk- of handelsnamen. De referentiepagina's vermelden het CAS-nummer per verbinding, zodat literatuur en productdocumentatie aan elkaar te koppelen zijn.
Zie ookSequentieMolecuulformule
Verder lezenReferentiepagina's per verbinding
Certificate of Analysis, CoA
Batchspecifiek analysedocument: de analytische handtekening van een productielot. Een bruikbare CoA vermeldt minimaal de identiteit (massaspectrometrie), de HPLC-zuiverheid met methode, het tegenion, het watergehalte, de net peptide content en het batchnummer met opslagadvies.
Zie ookZuiverheidMassaspectrometrieNet peptide content
Verder lezenEen certificaat van analyse lezenKwaliteit en analyse
Grafische uitvoer van een chromatografische scheiding: signaalintensiteit uitgezet tegen de tijd. Elke piek hoort bij een component van het monster; het aandeel van het hoofdpiekoppervlak in het totale piekoppervlak levert het zuiverheidspercentage.
Zie ookHPLCRetentietijdZuiverheid
Bijproduct van peptidesynthese waarin een of meer aminozuren ontbreken doordat een koppelingsstap onvolledig verliep. Deletiesequenties lijken chemisch sterk op het doelpeptide en vormen een typische onzuiverheidsklasse; massaspectrometrie maakt ze zichtbaar als massaverschil.
UV-detectie, voor peptiden doorgaans 220 nm
De golflengte waarop de UV-detector van een HPLC-systeem absorptie meet, voor peptiden doorgaans 220 nm: daar absorbeert de peptidebinding. Bestanddelen zonder UV-absorptie bij die golflengte, zoals water en zouten, blijven buiten de meting; dat is de reden dat HPLC-zuiverheid niets zegt over het peptidegehalte per milligram.
Covalente zwavel-zwavelbinding tussen twee cysteineresiduen. Vrije thiolgroepen oxideren bij pH boven 7 snel tot disulfiden, waardoor de identiteit van het peptide verandert; sequenties met vrije cysteine worden daarom bij lagere pH gereconstitueerd en zuurstofarm gehanteerd.
Zie ookOxidatieReconstitutie
Dimethylsulfoxide
Organisch oplosmiddel voor hydrofobe of neutrale peptiden die slecht in water of buffer oplossen. Na het oplossen wordt verdund in water of buffer tot de werkconcentratie, omdat hoge concentraties organisch oplosmiddel biologische testsystemen verstoren.
Zie ookOplosbaarheidReconstitutie
Verder lezenOplosbaarheidstabel per verbinding
Lipopolysacharide uit de celwand van gramnegatieve bacteriën dat als contaminant in een eindproduct terecht kan komen. Wordt bepaald met de LAL-assay; de limiet volgens USP <85> is minder dan 0,5 EU per milligram.
Verder lezenKwaliteit en analyse
Elektrospray-ionisatie
Ionisatietechniek voor massaspectrometrie waarbij het opgeloste peptide via een elektrisch geladen nevel in de gasfase wordt gebracht. Op certificaten vaak vermeld als ESI-MS of ESI-TOF, naar de gebruikte massa-analysator.
Zie ookMassaspectrometrieLC-MS
Afgesloten vat met droogmiddel waarin een koude vial op kamertemperatuur kan komen zonder vocht aan te trekken. Peptiden zijn hygroscopisch; een vial die koud wordt geopend, condenseert vocht op het lyofilisaat en verhoogt zo de effectieve wateractiviteit in het product.
Zie ookHygroscopischLyofilisatie
Good Manufacturing Practice
Kwaliteitssysteem voor productieomgevingen: gevalideerde processen, gedocumenteerde procedures en traceerbare grondstoffen. De synthese van de catalogusverbindingen vindt plaats in GMP-conforme faciliteiten.
Zie ookSPPSISO/IEC 17025
Verder lezenKwaliteit en analyse
HPLC-werkwijze waarbij de samenstelling van de mobiele fase tijdens de analyse geleidelijk verandert, zodat componenten met uiteenlopende hydrofobiciteit binnen een analyse gescheiden raken. Kolom, gradiënt en detectiegolflengte horen bij een zuiverheidsbepaling op het certificaat vermeld te staan.
Zie ookHPLCRetentietijd
High-Performance Liquid Chromatography
Scheidingstechniek waarmee de zuiverheid van een peptide wordt bepaald: het monster wordt onder hoge druk over een kolom geleid en componenten verlaten de kolom op verschillende momenten. De zuiverheid is het aandeel van het hoofdpiekoppervlak in het totale piekoppervlak bij de detectiegolflengte, voor peptiden doorgaans in reverse-phase-configuratie.
Zie ookReverse-phase chromatografieRetentietijdZuiverheid
Verder lezenKwaliteit en analyse
Splitsing van een chemische binding onder opname van water. Bij peptiden in oplossing kan hydrolyse de hoofdketen of zijketens aantasten, onder meer bij asparagineresiduen; lage temperatuur en een kort bewaarvenster van oplossingen beperken het effect.
De eigenschap vocht uit de omgevingslucht aan te trekken. Gelyofiliseerde peptiden zijn hygroscopisch: opgenomen vocht verhoogt het watergehalte, verstoort het afwegen en versnelt degradatie tijdens opslag.
Zie ookExsiccatorWatergehalte
Internationale norm voor de competentie van test- en kalibratielaboratoria. Analyses die conform ISO/IEC 17025 worden uitgevoerd, volgen gevalideerde methoden met geborgde meetonzekerheid en gedocumenteerde traceerbaarheid.
Zie ookGMP
Verder lezenKwaliteit en analyse
Titratiemethode die het watergehalte van een lyofilisaat bepaalt. Typische waarden voor een goed gevriesdroogd peptide liggen rond enkele procenten; sterk verhoogde waarden wijzen op onvolledige lyofilisatie of vochtopname tijdens opslag.
Zie ookWatergehalteLyofilisatie
Limulus Amebocyte Lysate
Test die endotoxinen aantoont met lysaat van amoebocyten uit de degenkrab. Standaardmethode voor de endotoxinebepaling van onderzoekspeptiden, met limieten volgens USP <85>.
Zie ookEndotoxineUSP
Verder lezenKwaliteit en analyse
Liquid Chromatography-Mass Spectrometry
Combinatie van vloeistofchromatografie en massaspectrometrie: de chromatograaf scheidt de componenten van een monster, de massaspectrometer meet vervolgens hun massa. Bevestigt de identiteit van een peptide, complementair aan de HPLC-zuiverheidsmeting.
Zie ookHPLCMassaspectrometrie
Verder lezenKwaliteit en analyse
Vriesdrogen
Droogproces waarbij een bevroren oplossing onder vacuüm water verliest door sublimatie. Het resultaat, het lyofilisaat, is de meest stabiele vorm van een peptide en wordt tot gebruik gesloten en koel bewaard; reconstitutie zet het weer om in een oplossing.
Zie ookReconstitutieHygroscopischKarl Fischer-titratie
Verder lezenReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
MS
Analysetechniek die de molecuulmassa meet en daarmee de identiteit van een peptide bevestigt: een scherpe piek in het chromatogram zegt niets als de massa niet bij de bedoelde sequentie hoort. Op een certificaat staat de gemeten massa naast de theoretische waarde; een verschil binnen ongeveer 1 Da is voor de meeste peptiden acceptabel.
Zie ookMonoisotopische massaLC-MSAdduct
Verder lezenEen certificaat van analyse lezen
Notatie van het aantal atomen per element in een molecuul, bijvoorbeeld C62H98N16O22 voor BPC-157. Vast onderdeel van de eigenschappen in de productdocumentatie en op het certificaat van analyse.
Zie ookMolecuulmassaSequentie
Verder lezenEigenschappen van BPC-157
Massa van een molecuul, voor peptiden meestal uitgedrukt in gram per mol (g/mol) of dalton (Da). De theoretische molecuulmassa volgt uit de sequentie; massaspectrometrie toetst of de gemeten massa daarmee overeenkomt. Daarnaast is de molecuulmassa de rekenbasis voor molaire concentraties bij reconstitutie.
Zie ookMonoisotopische massaMassaspectrometrie
Verder lezenReconstitutiecalculator
Molecuulmassa berekend met de meest voorkomende isotoop van elk element. Bij hoogresolutie-massaspectrometrie wordt de gemeten massa vergeleken met de theoretische monoisotopische massa van de sequentie.
Netto peptidegehalte
Het aandeel werkelijk peptide in het gewogen materiaal. Een lyofilisaat bevat naast peptide ook tegenionen en restwater: een batch kan 99% zuiver zijn op HPLC en toch maar 80% peptide per gewogen milligram bevatten. Wie een exacte hoeveelheid nodig heeft, corrigeert de inweeg met dit percentage; zonder die correctie valt elke berekening systematisch te laag uit.
Zie ookTegenionWatergehalteAminozuuranalyseZuiverheid
Verder lezenEen certificaat van analyse lezen
In welk oplosmiddel en tot welke concentratie een peptide oplost. De keuze volgt uit de netto lading en de hydrofobiciteit van de sequentie: basische peptiden lossen op in verdund zuur, zure peptiden in een milde base, en hydrofobe sequenties vragen een organisch oplosmiddel. Het advies per verbinding staat in de oplosbaarheidstabel.
Zie ookReconstitutieDMSOPBS
Verder lezenOplosbaarheidstabel per verbindingReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
Chemische degradatieroute waarbij een residu elektronen verliest, bij peptiden vooral aan methionine, cysteine en tryptofaan. Oxidatiegevoelige sequenties worden beschermd door zuurstofarm te werken, de vial met inert gas te purgeren en voor tryptofaanhoudende sequenties donkere vials te gebruiken.
Zie ookDisulfidebrugVries-dooicyclus
Verder lezenReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
Phosphate-Buffered Saline, fosfaatgebufferde zoutoplossing
Waterige buffer met een pH van 7,0 tot 7,4 en een fysiologische zoutconcentratie. Geschikt als oplosmiddel voor veel peptiden bij werkconcentraties tot ongeveer 1 mg/mL; uitzondering zijn sequenties met vrije cysteine, waarvan de thiolgroepen bij deze pH oxideren.
Zie ookOplosbaarheidDisulfidebrug
Keten van aminozuren die via peptidebindingen aan elkaar gekoppeld zijn, korter dan een eiwit; de meeste onderzoekspeptiden tellen enkele tot enkele tientallen residuen. De sequentie bepaalt de identiteit en het fysisch-chemische gedrag, van oplosbaarheid tot degradatiegevoeligheid.
Verder lezenReferentiepagina's per verbinding
Europese Farmacopee (Pharmacopoea Europaea)
Verzameling bindende Europese kwaliteitsnormen en analysemethoden voor farmaceutische stoffen en hulpstoffen. Methodereferenties op certificaten verwijzen naar hoofdstukken als Ph. Eur. 2.2.29 (vloeistofchromatografie) en 2.2.43 (massaspectrometrie).
Zie ookUSP
Verder lezenKwaliteit en analyse
Het weer oplossen van een gelyofiliseerd peptide in een geschikt oplosmiddel tot een stamoplossing van bekende concentratie. De oplosmiddelkeuze volgt uit de sequentie; massa, volume en concentratie zijn met de reconstitutiecalculator om te rekenen.
Zie ookLyofilisatieStamoplossingOplosbaarheid
Verder lezenReconstitutiecalculatorReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
De tijd tussen injectie van een monster in een chromatografisch systeem en het moment waarop een component de detector passeert. Onder vaste condities is de retentietijd karakteristiek voor een verbinding en dient hij als extra identiteitscontrole naast de massabepaling; het certificaat vermeldt de retentietijd van de hoofdpiek.
Zie ookHPLCChromatogram
RP, omgekeerde-fasechromatografie
Chromatografie met een apolaire stationaire fase, voor peptiden doorgaans een C18-kolom, en een polaire mobiele fase. Componenten verlaten de kolom in volgorde van toenemende hydrofobiciteit. RP-HPLC is de standaardconfiguratie voor de zuiverheidsbepaling van peptiden.
De volgorde van aminozuren in een peptide, genoteerd in drieletter- of eenlettercode. De sequentie definieert de identiteit van de verbinding en bepaalt lading, hydrofobiciteit en degradatiegevoeligheid. Per verbinding staat de sequentie op de referentiepagina en het certificaat van analyse.
Verder lezenReferentiepagina's per verbinding
Solid-Phase Peptide Synthesis, vaste-fasepeptidesynthese
Synthesemethode waarbij de peptideketen aminozuur voor aminozuur wordt opgebouwd aan een onoplosbare harskorrel, met een wasstap na elke koppeling. Na voltooiing wordt het peptide met trifluorazijnzuur van de hars gesplitst; vandaar dat het eindproduct doorgaans als TFA-zout ontstaat. SPPS is de standaardmethode voor synthetische onderzoekspeptiden.
Zie ookTFA-zoutDeletiesequentie
Verder lezenKwaliteit en analyse
Stock solution
De geconcentreerde oplossing die direct na reconstitutie ontstaat en waaruit verdunningen voor een experiment worden gemaakt. De concentratie volgt uit de ingewogen massa, gecorrigeerd voor net peptide content, gedeeld door het toegevoegde volume; de reconstitutiecalculator rekent dit om.
Zie ookReconstitutieAliquotNet peptide content
Verder lezenReconstitutiecalculator
Total Aerobic Microbial Count / Total Yeast and Mould Count
Kiemgetalbepalingen voor respectievelijk aerobe bacteriën en gisten en schimmels. Onderdeel van de microbiologische controle van een batch volgens USP <61>, met een limiet van minder dan 100 CFU per gram.
Zie ookUSPEndotoxine
Verder lezenKwaliteit en analyse
Counterion
Ion dat de lading van basische of zure groepen in het peptide compenseert en meeweegt in het lyofilisaat. Synthetische peptiden dragen typisch TFA of acetaat als tegenion. Omdat het tegenion meetelt in het brutogewicht, verklaart het samen met restwater het verschil tussen HPLC-zuiverheid en net peptide content.
Zie ookTFA-zoutAcetaatNet peptide content
Verder lezenEen certificaat van analyse lezen
Trifluoracetaat, zout van trifluorazijnzuur
De zoutvorm waarin synthetische peptiden doorgaans geleverd worden: trifluorazijnzuur (TFA) uit de afsplitsingsstap van de synthese blijft als tegenion gebonden aan de vrije N-terminus en basische zijketens. TFA kan fysisch-chemische karakterisering en celkweekexperimenten beïnvloeden; waar dat relevant is, wordt het uitgewisseld voor acetaat of hydrochloride. De zoutvorm staat op het certificaat van analyse.
Verder lezenEen certificaat van analyse lezen
United States Pharmacopeia
Amerikaanse farmacopee met genummerde hoofdstukken voor analysemethoden en limieten, zoals USP <85> voor endotoxinen en USP <61> voor microbiologische controle. Wordt naast de Europese Farmacopee gebruikt als referentiekader op certificaten.
Een keer invriezen en weer ontdooien van een oplossing. Elke cyclus verhoogt de kans op degradatie, onder meer door aggregatie en microcondensatie tijdens het ontdooien; herhaalde cycli stapelen meetbaar op, ook als de oplossing er onveranderd uitziet. Aliquoteren bij de eerste reconstitutie ondervangt dit.
Zie ookAliquotAggregatie
Verder lezenReconstitutie en opslag van onderzoeksproducten
Het aandeel restwater in een lyofilisaat, bepaald met Karl Fischer-titratie. Enkele procenten is normaal; verhoogde waarden wijzen op onvolledige lyofilisatie of vochtopname tijdens opslag en drukken het werkelijke peptidegehalte per gewogen milligram.
Zie ookKarl Fischer-titratieNet peptide contentHygroscopisch
HPLC-zuiverheid
Het aandeel van het hoofdpiekoppervlak in het totale piekoppervlak van een HPLC-analyse, uitgedrukt als percentage bij de detectiegolflengte. Zegt welke fractie van het UV-zichtbare materiaal het doelpeptide is, maar niet hoeveel peptide het gewogen materiaal bevat: daarvoor dient de net peptide content. Voor onderzoekspeptiden is ≥98% de gangbare drempel.
Zie ookHPLCNet peptide contentDetectiegolflengte
Verder lezenKwaliteit en analyseEen certificaat van analyse lezen
Referentiepagina's per verbindingOplosbaarheid en opslag van alle verbindingenReconstitutiecalculatorKwaliteit en analyse